雖說斗六在清領時期境內早已諸多埤圳，但大小規模不一且獨立。日治時期，斗六地方人士有鑑於嘉南大圳工程通水竣工的影響，而認為透過大圳的興建，達到土地灌溉與改良。以斗六地區仕紳為首在昭和2年（1927）組織「斗六大圳促進期成同盟會」，昭和15年（1940）總督府通過補助半數工程款，籌畫則委由嘉南大圳水利組合代辦。

2016年正式啟用的湖山水庫，是台灣少見的離槽水庫，也是雲林縣境內的第一座水庫，位於斗六市與古坑鄉之間，主要流域以梅林溪與清水溪為主。但其實早在湖山水庫規畫動工之前，台灣省水利局第一規劃調查隊，於民國61年12月已提出利用清水溪河系，建立全仔水庫的規劃調查研究報告。

樟湖貝殼化石散佈於樟湖風景區吊橋下，清水溪支流石鰻坑溪的河床上。貝殼化石是海扇貝類化石的密集區，貝類化石層大約有30公分厚，這些貝類化石為斧足類，有海扇蛤、錦星善蛤、錐螺、黃玉螺等，此外一些單體珊瑚和少許海膽化石也可在此見到，年代估計約在350至500萬年之間。此區到處可看到密密麻麻的貝殼化石，以扇貝化石分佈最多，堪稱臺灣極為特殊的化石奇觀。

古坑鄉樟湖村清水溪吊橋在民國88年慘遭921大地震重創後，由雲林縣府觀光課斥資9百萬餘元於民國92年8月14日重建完工，橋寬1.5公尺、橋長170公尺，造型宏偉，橫跨清水溪谷，氣勢磅礡。原本希望啟用後吸引觀光人潮回流，同時改善清水溪兩岸農產品運輸。