箔子寮漁港除了作為漁業發展的重要場所之外，更是雲林縣與澎湖縣間，一段曾經美好連結的過去。早在清領時期，雲林與澎湖之間的船隻便已往來不斷，但後因逐漸淤積而終止，不過兩地縣府始終都有再次通航的意願。在箔子寮漁港正式啟用之前，還有台西港是口岸的競爭對手，雙方皆積極踴躍。