<p>斗南車站設於明治36年（1903），早期稱為「他里霧驛」，車站一側還有座大日本製糖株式會社他里霧停車場（五分車站），與斗南驛採雙鐵共構，即所謂的三軌設計，可以走五分車也可以走一般的火車，過去虎尾糖廠在製糖產量高峰時，透過糖鐵五分車將糖成品從虎尾運到斗南再運回日本。此外，早期雲林海線的許多貨物都是透過糖鐵轉運到斗南，再經縱貫線火車配送至全台各地，或外銷出口。當時斗南車站是台鐵唯一一做24小時運轉的車站，可見其忙碌程度。</p><p>大正9年（1920）日本人調整行政區域，將他里霧更名為斗南。他里霧驛也改成斗南驛，昭和20年（1945），斗南驛在度進行改建，成為日本人在台灣建造的最後一座車站。現在的站體為配合台鐵捷運化政策，將改建為跨站式站房，預計2020年12月31日完工。</p>